Выделение и очистка нуклеиновых кислот

Наборы GeneJET Plasmid Miniprep предназначены для выделения плазмидной ДНК из бактерий с использованием технологии спин-колонок. Сорбция происходит на мембране из диоксида кремния. Набор позволяет получить до 20 мкг высококопийной плазмидной ДНК за одну процедуру выделения.

Преимущества набора GeneJET Plasmid Miniprep:

• процедура выделения занимает менее 14 минут;
• не требуется экстракция фенолом/хлороформом или осаждение спиртом;
• очищенная ДНК немедленно готова к использованию;
• совместим с вакуумным коллектором для увеличения пропускной способности;
• оптимизирован для выделения ДНК бактерий.

Выделенная набором GeneJET Plasmid Miniprep ДНК пригодна для следующих молекулярно-биологических манипуляций:

• рестрикции и модификации;
• автоматизированного флуоресцентного и радиоактивного секвенирования;
• ПЦР;
• in vitro транскрипции;
• трансформации.

Состав набора GeneJET Plasmid Miniprep:

• раствор для ресуспендирования клеток;
• раствор для лизиса клеток; раствор для нейтрализации лизата;
• промывочный раствор (концентрат);
• раствор РНКазы А;
• буфер для элюции;
• спиновые колонки;
• трубки для сбора элюата;
• подробный протокол работы.

Культуру клеток собирают и лизируют. Затем лизат очищают центрифугированием и наносят на колонку с кремнеземом для селективного связывания молекул ДНК при высокой концентрации соли. Адсорбированную ДНК промывают для удаления загрязнений, а чистую плазмидную ДНК элюируют в небольшом объеме элюционного буфера или воды.

Условия хранения и перевозки - комнатная температура.

Набор обеспечивает простой, надежный и быстрый метод выделения высококачественной тотальной РНК из образцов тканей, зафиксированных в формалине и залитых парафином (FFPE), для ретроспективных базовых и клинических биологических исследований экспрессии генов без использования токсичных органических растворителей для депарафинизации, таких как ксилол.

Преимущества набора PureLink FFPE RNA Isolation Kit:

• быстрая процедура выделения (30 минут);
• выход тотальной РНК превышает 1 мкг из 3-8 парафиновых срезов (10 мкм);
• обеспечивает более высокий выход и чистоту РНК по сравнению с другими коммерчески доступными наборами, позволяя получать продукты ОТ-ПЦР длиной более 1 т.п.н.;
• минимальное загрязнение геномной ДНК.

Выделенная ДНК может использоваться для следующих приложений:

• обратная транскрипция;
• ПЦР в реальном времени;
• нозерн-блоттинг;
• микрочиповый анализ (microarray).

Условия хранения и перевозки: при комнатной температуре.

Набор позволяет эффективно выделить общую ДНК примерно за 40 минут из различных образцов растений, таких как шпинат, помидоры, соя, пшеница, арабидопсис, а также из грибов. Масса образца составляет всего 100 мг.

Преимущества набора PureLink Genomic Plant DNA Purification Kit:

• быстрая процедура выделения (40 минут);
• выделенная ДНК имеет размер 20-50 тыс. п.н.;
• выход ДНК варьирует в зависимости от образца, и составляет (из 100 мг):
• кукуруза — 4,4-6,6 мкг;
• соя — 0,3-2 мкг;
• подсолнечник — 1,6-4 мкг;
• Arabidopsis thaliana — 1,8-3,1 мкг;
• грибы — 1,1-1,4 мкг;
• эффективность выделения ДНК составляет более 80%.
• выделенная ДНК имеет A260/280 >1,8.

Выделенная ДНК может использоваться для следующих приложений:

• ПЦР;
• саузерн-блоттинг;
• гидролиз эндонуклеазами рестрикции;
• секвенирование.

Условия хранения и перевозки: при комнатной температуре.

Набор позволяет выделять высококачественную тотальную РНК из 50-500 мкл цельной крови млекопитающих без использования фенола с применением микроцентрифужной колонки. Набор разработан для выделения РНК из свежей, а не замороженной цельной крови любого вида млекопитающих.

Преимущества набора PureLink Total RNA Blood Kit:

• быстрая процедура выделения (менее 60 минут);
• выделение РНК производят из цельной крови объемом 50-500 мкл (3,5 x 10⁶ лейкоцитов);
• выход РНК варьирует и зависит от времени, прошедшего с забора крови и состояния здоровья донора;
• минимальное загрязнение геномной ДНК.

Выделенная РНК может использоваться для следующих приложений:

• обратная транскрипция;
• ПЦР в реальном времени;
• нозерн-блоттинг;
• микрочиповый анализ (microarray).

Набор обеспечивает быстрый и эффективный метод одновременного выделения вирусной РНК и ДНК из свежих или замороженных биологических жидкостей, не содержащих клеток (плазма, сыворотка спинномозговая жидкость) и из супернатантов клеточных культур.

Преимущества набора PureLink Viral RNA/DNA Mini Kit:

• быстрая процедура выделения (45 минут);
• позволяет получить элюаты нуклеиновых кислот малых объемов — 10-50 мкл;
• используется РНК-носитель (тРНК дрожжей), которая увеличивает выход и уменьшает деградацию нуклеиновых кислот;
• отсутствие загрязнения белками и нуклеазами.

Выделенные нуклеиновые кислоты могут использоваться для следующих приложений:

• ОТ-ПЦР;
• ПЦР в реальном времени;
• нозерн-блоттинг;
• микрочиповый анализ (microarray).

Условия хранения и перевозки: при комнатной температуре. РНК-носитель хранится при -20°С.

Набор предназначен для колоночной экстракции вирусной ДНК/РНК из различных типов образцов. Набор использует уникальную систему лизиса, не требующую высокотемпературной инкубации, и позволяет значительно повысить скорость извлечения следовых нуклеиновых кислот с РНК-носителем. После специфической адсорбции на силикагелевой мембране вирусная ДНК/РНК может быть быстро и эффективно очищена. Для одного образца требуется всего 12 минут для завершения экстракции. Полученные продукты можно напрямую использовать для последующих экспериментов, таких как ОТ- ПЦР, ПЦР в реальном времени, секвенирование по технологии (NGS) и нозерн блотт.

Преимущества набора

• Выскопроизводительный набор, позволяет выделить ДНК/РНК даже из маленького количества образца вируса;
• подходит для цельной крови, сыворотки, плазмы, мазков, тканей, жидкости альвеолярного отделяемого, супернатанта клеточных культур и других образцов;
• работает при комнатной температуре.
  

Условия хранения/транспортировки:

• пакет 1: от -30 до -15 °C / ≤ 0 °C,
• пакет 2: от 15 до 25 °C / при комнатной температуре.

Набор может использоваться для экспресс-выделения чистой вирусной ДНК/РНК мазков из носоглотки, мазков из окружающей среды, супернатанты клеточных культур и супернатанты гомогенатов тканей. В основе набора используется технология очистки кремнеземной мембране. Не требует использования органических растворителей фенола/хлороформа или трудоемкого осаждения спиртом для выделения вирусной ДНК/РНК высокого качества. Полученные нуклеиновые кислоты не содержат примесей и могут использоваться для последующих экспериментов ОТ-ПЦР, реал-тайм ПЦР, секвенирование по технологии (NGS) и нозерн блотт.

Преимущества набора

• Время выделения из одного образца составляет всего 7 минут;
• нет необходимости в высокотемпературной инкубации и криоцентрифугировании.

Условия хранения/транспортировки: от 15 до 25 °C / при комнатной температуре.

Набор предназначен для выделения нефрагментированной геномной ДНК из крови и культур животных клеток.

Особенности набора:

• выделение высокомолекулярной ДНК длиной до 150 тыс п.н.;
• нет стадий органической экстракции или спиртовой преципитации;
• параллельное выделение из нескольких образцов.

Выделение ДНК происходит на анионообменных колонках Qiagen Genomic-tip 20/G, рассчитанных на получение до 20 мкг высокомолекулярной ДНК со средним размером фрагментов 50-100 тыс п.н. Это делает данный метод оптимальным при выделении ДНК для нанопорового секвенирования.

Протекание реагентов через колонки происходит под действием силы тяжести, поэтому насос не требуется.

Колонки Qiagen Genomic-tip также предназначены для выделения ДНК из других биологических образцов — крови, тканей, клеточных культур, бактерий и дрожжей и могут быть приобретены отдельно.

Набор предназначен для выделения геномной ДНК из бактериальных культур. Выделение ДНК начинается с лизиса бактериальных клеток в присутствии РНКазы и протеиназы К. Затем лизат наносится на спин-колонку diaGene с силикагелевым сорбентом. Очистка ДНК на спин-колонках начинается с избирательного связывания ДНК с сорбентом в присутствии хаотропной соли с последующей отмывкой связанной ДНК от примесей и заканчивается элюцией чистого препарата ДНК.

Сорбент позволяет выделять до 20 мкг свободной от примесей ДНК длиной 5-50 тысяч пар нуклеотидов.

Набор diaGene для выделения геномной ДНК из бактериальных клеток, инструкция по применению, Диаэм, русск., 2 стр.

SPINeasy DNA Kit for Water — высокоэффективный набор для быстрого выделения геномной ДНК из водных образцов на основе технологии силикагелевых спин-колонок. Набор позволяет выделять гДНК менее чем за 30 минут и обеспечивает высокий выход и чистоту ДНК, готовой к последующим молекулярно-биологическим приложениям.

В наборе используются специально разработанные лизирующий буфер W1 и лизирующая матрица E, обеспечивающие эффективный лизис различных типов клеток. Колонки W1 обладают высокой ёмкостью и селективностью связывания геномной ДНК, что позволяет получать ДНК, пригодную для ПЦР, рестрикционного анализа и секвенирования без дополнительной очистки.

Тип образца: cточные воды, природные и экологические водные образцы, включая пресную и морскую воду, воду из прудов и рек.

Объём образца: до 500 мг.

Состав набора:

• лизирующая матрица E, 50×5 мл;
• лизирующий буфер W1, 60 мл;
• лизирующий буфер W2, 8 мл;
• раствор RNase A, 550 мкл;
• реагент для удаления ингибиторов W, 15 мл;
• буфер связывания W, 30 мл;
• буфер промывки W1, 9 мл;
• буфер промывки W2, 6 мл;
• буфер DES, 10 мл;
• фильтрующие мембраны, 50 шт.;
• колонки W1, 50 шт.;
• пробирки для сбора 2 мл, 50 шт.;
• пробирки для сбора 1,5 мл, 50 шт.

Условия хранения: хранить при комнатной температуре (15–25 °C) в сухом месте.

Набор выводится из линейки и будет постепенно вытеснен набором DNeasy Plant Pro Kit (69204 — 50 выделений, 69206 — 250 выделений).

Набор для выделения ДНК из клеток, присутствующих в почве или других экологических пробах (экскременты, вода из водоемов, сточные воды, ил) до 300 мг. Рекомендуется использовать с гомогенизатором FastPrep или с альтернативным прибором.

Набор для почвы эффективно менее чем за 30 минут выделяет из почвы геномную ДНК, готовую к использованию в ПЦР.

Растительные и животные ткани, бактерии, водоросли, споры грибов и другие почвенные организмы легко лизируются в течение 40 секунд.

Разрушение клеток в гомогенизаторе обеспечивается угловым движением адаптера с траекторией в форме «восьмёрки» с одновременной разнонаправленной бомбардировкой образцов лизирующими матрицами, находящимися в пробирках вместе с буферным раствором, что обеспечивает высокую воспроизводимость, превосходящую традиционную методы выделения.

До 500 мг почвенной пробы помещают в 2 мл пробирки, содержащие Лизирующую матрицу E – смесь стеклянных (4 мм в диаметре), кварцевых (0,1 мм в диаметре) и керамических (1,4 мм в диаметре) шариков, способных эффективно разрушать все почвенные организмы, включая трудные для лизиса споры эубактерий, эндоспоры, грамположительные бактерии, дрожжи, водоросли, нематоды и грибы.

Гомогенизация происходит в присутствии МТ буфера и буфера фосфата натрия, реагенты для лизиса были тщательно разработаны, чтобы защитить от растворения нуклеиновые кислоты и белки при лизисе клеток. Эти реагенты эффективно работают вместе, облегчая выделение ДНК, максимально снижая контаминацию от РНК. По завершению лизиса образцы центрифугируются, в результате чего образуется осадок из разрушенных частиц почвы, мусора и матрицы. Полученную ДНК очищают, используя технология GENECLEAN , применяющая силикагелевые фильтры SPIN и устраняющая гуминовые кислоты и полифенолы, которые могут препятствовать ПЦР.

Элюированная ДНК полностью готова к использованию для электрофореза, ПЦР и другим исследованиям.

Спецификация: Тип набора: для выделения НК. Тип пробы: почва, экскременты, вода из водоемов, сточные воды, ил. Пробирки: 2 мл Совместимы с гомогенизатором: FastPrep-24 и FastPrep-96 Состав матрицы: матрица E: 1,4 мм керамический шарик, 0,1 мм кварцевый шарик и один 4 мм стеклянный шарик. Выделяемые молекулы: ДНК Состав набора:

• Лизирующий матрикс Е в пробирках, 50×2,0 мл; спин–колонки, 50 шт;
• пробирки-ловушки для сбора чистой ДНК, 50 шт;
• буфер MT, 8 мл;
• натрия фосфатный буфер, 60 мл;
• раствор PPS для осаждения белков, 25 мл;
• связывающий матрикс, 66 мл;
• концентрированный промывочный раствор, 12 мл;
• раствор для элюции ДНК 20 мл;
• краситель BBS для геля, 200 мкл;
• паспорт безопасности MSDS;
• сертификат анализа.

Необходимые материалы, не входящие в комплект (не поставляются): Гомогенизатор FastPrep или альтернативный прибор с высокой скоростью вращения (микроцентрифуга), в который можно свободно устанавливать для вращения 2,0 мл пробирки; микроцентрифужные пробирки (2,0 мл или 1,5 мл); 15 мл стерильные пробирки для связывания ДНК; ротатор.

Условия хранения и транспортировки: 15–30 °C.

Листовка по экстракции ДНК из андосоля, вулканической почвы здесь

Набор предназначен для выделения тотальной ДНК из растительных клеток и тканей, а также из грибов.

Особенности набора:

• быстрое выделение чистой ДНК, готовой к дальнейшему использованию;
• нет стадий органической экстракции или спиртовой преципитации;
• ДНК свободна от ингибиторов ПЦР и других загрязнений.

Набор рассчитан на свежие, замороженные или сухие образцы массой до 100 мг (в пересчёте на свежий материал). Выход ДНК составляет до 30 мкг (в зависимости от вида растения и происхождения материала). Выделенная ДНК имеет длину фрагментов в среднем 20-25 тыс. п.н. и не содержит полисахаридов и других примесей, типичных для стандартных методов выделения растительной ДНК.

Для получения максимального выхода и чистоты ДНК рекомендуется новый набор DNeasy Plant Pro Kit.

SPINeasy DNA Pro Kit for Soil специально разработан для выделения высокочистовой геномной ДНК микробиома из сложных типов почв, включая образцы с низкой биомассой и/или высоким уровнем загрязнений. Набор обеспечивает эффективный лизис широкого спектра микроорганизмов, включая бактерии, грибы, вирусы и простейшие.

Набор обеспечивает выход ДНК, сопоставимый с хорошо зарекомендовавшим себя FastDNА SPIN Kit, при этом отличается повышенной чистотой ДНК и сокращённым временем пробоподготовки. Полученная ДНК не демонстрирует ингибирования в ПЦР и готова к использованию в последующих приложениях без дополнительных этапов удаления ингибиторов.

Тип образца: почва (до 500 мг), включая песок, щёлочные почвы, глину, осадки и верхний слой почвы.

Объём образца: до 500 мг.

Состав набора:

• Lysing Matrix YB (50×);
• RNase A Solution, 2 мл;
• буферы S1–S6;
• колонки S (50×);
• пробирки для сбора 2 мл (50×);
• пробирки 1,5 мл (50×).

Условия хранения: хранить при комнатной температуре (15–25 °C) в сухом месте.

Набор предназначен для оперативного выделения высококачественной геномной ДНК (гДНК) из дрожжей, основанного на технологии спин-колонок с силикагелевой мембраной. Этот метод обеспечивает быструю и эффективную очистку гДНК без использования токсичных реагентов, таких как фенол и хлороформ.

В основе набора лежит способность ДНК сорбироваться на мембране из диоксида кремния в присутствии хаотропных солей. После лизиса дрожжевых клеток и добавления связывающего буфера, ДНК селективно связывается с мембраной спин-колонки. Затем проводятся этапы промывки для удаления контаминантов, таких как белки, РНК и клеточные остатки. Наконец, чистая гДНК элюируется с колонки низкосолевым буфером или водой. Выделенная гДНК идеально подходит для большинства молекулярно-биологических экспериментов, для ПЦР и количественной ПЦР (qPCR), гибридизации по Саузерну и Нозерну, гидролиза эндонуклеазами рестрикции, секвенирования и т.д.

Преимущества набора для выделения геномной ДНК из дрожжей SPINeasy DNA for Yeast

• Быстрая процедура выделения (менее 30 минут);
• количество образца до 4×10⁸ клеток;
• объем образца 50-200 мкл;
• выход гДНК до 12 мкг (зависит от образца);
• не требуется экстракция фенолом/хлороформом или осаждение спиртом;
• выделенная гДНК свободна от ингибиторов ПЦР и пригодна для широкого спектра молекулярно-биологических применений;
• готовые к использованию буферы и оптимизированный протокол.

Условия хранения: комнатная температура.

Набор позволяет выделять геномную ДНК с высоким выходом и высокой чистотой из широкого спектра образцов животного происхождения (кровь, ткани, клетки, мазки) и из бактерий. Для каждого типа образца имеется отдельный оптимизированный протокол, описанный в инструкции.

Преимущества набора PureLink Genomic DNA Mini Kit:

• быстрая процедура выделения (30 минут);
• выделенная ДНК имеет размер 20-50 тыс. п.н;
• выход ДНК варьирует в зависимости от образца, но составляет не менее 4 мкг;
• эффективность выделения ДНК составляет более 80%;
• выделенная ДНК имеет A260/280 >1,7.

Выделенная ДНК может использоваться для следующих приложений:

• ПЦР;
• саузерн-блоттинг;
• гидролиз эндонуклеазами рестрикции;
• секвенирование.

Условия хранения и перевозки: при комнатной температуре.

Набор предназначен для выделения геномной ДНК из тканей, фиксированных в формалине и парафинированных (FFPE), преодолевая ингибирующий эффект, вызванный сшиванием формалина. Раствор для депарафинизации в этом наборе более безопасен, чем ксилол. Спин — колонка и уникальная буферная система, входящая в состав данного набора обеспечивают высокое качество получаемой ДНК. Весь процесс выделения занимает всего 20 минут (время ферментации не учитывается). Выделенная геномная ДНК целостная, высокой чистоты и стабильная, может быть использована для широкого спектра последующих экспериментов, включая ПЦР-анализ, количественная ПЦР и подготовку библиотек.

Преимущества набора

• Депарафинизация с помощью нетоксичного депарафинизирующего раствора;
• обработка нескольких образцов без ночной инкубации.

Хранение:

• порошок протеиназы К: хранить при температуре от 2 до 8 °C;
• раствор Протеиназы К хранить при -30 до -15 °C.

Остальные компоненты следует хранить от 15 до 25 °C и транспортировать при комнатной температуре.

Данный набор предназначен для выделения геномной ДНК из штаммов грамположительных и грамотрицательных бактерий. В состав набора входит колонка очистки на силикагеле. С данным набором не нужно использовать органические растворители (фенол/хлороформ) или осаждать спиртом. Набор позволяет эффективно очистить образец ДНК от органических смесей: остатков РНК, белков, липидов и других ингибирующих примесей. Полученная ДНК применима для дальнейшего ПЦР-анализа, количественной ПЦР, рестрикционного анализа, саузерн-блота и т.д.

Преимущества набора

• Получение геномной ДНК бактерий в течение всего 30 минут;
• подходит для грамположительных и для грамотрицательных бактерий;
• высокий выход чистой бактериальной и геномной ДНК, которая готова к использованию в различных экспериментах.

Условия хранения/транспортировки: от -30 до -15 °C / при комнатной температуре.

Остальные компоненты следует хранить при температуре от 15 до 25 °C.

Набор предназначен для выделения геномной и митохондриальной ДНК из микрообразцов (от 1 до 100 мкл) крови, других биологических жидкостей и клеточных лизатов.

Особенности набора:

• быстрое выделение чистой ДНК, готовой к использованию;
• нет стадий органической экстракции или спиртовой преципитации;
• стабильный высокий выход ДНК;
• ДНК свободна от ингибиторов и других примесей.

Выделение ДНК происходит на спин-колонках с мембраной из диоксида кремния и может производиться как вручную, так и автоматически с помощью станции QIAcube. В состав набора входят колонки QIAamp MinElute, позволяющие элюировать чистую ДНК всего в 20 мкл. Выход чистой ДНК с колонок QIAamp MinElute составляет до 3 мкг.

Набор QIAamp DNA Miсro Kit можно также использовать для выделения ДНК из образцов ткани после лазерной микродиссекции, для выделения ДНК в криминалистике (но рекомендуется QIAamp DNA Investigator Kit) или для очистки ДНК от примесей или из реакционных смесей.

Набор позволяет извлекать фрагменты ДНК размером от 70 пар нуклеотидов до 20 kb из агарозного геля, приготовленного на трис-ацетатном (ТАЕ) или трис-боратном (TBE) буферных системах различных концентраций. Набор содержит уникальную буферную систему, а также колонки на основе силикагеля. Данное сочетание оптимальной буферной системы с силикагелевой колонкой позволяет эффективно осаждать ДНК в условиях высоких концентрациях солей. Данный набор может использоваться для очистки фрагментов ДНК из продуктов ПЦР, ферментативных реакционных систем, удаления органических примесей, ионов неорганических солей. Извлечение ДНК из геля с использованием набора FastPure мини сокращает время выделения до 15 минут. Экстрагированная ДНК далее применима для следующих задач: лигирования, трансформации, рестрикиционного анализа, транскрипции, ПЦР-анализа, секвенирования, микроинъекции.

Условия хранения: от 15 до 25 °C.

Транспортировка: при комнатной температуре.

Набор предназначен для выделения ДНК из гистологических препаратов, фиксированных в формалине и залитых парафином. Выделение ДНК начинается с растворения и удаления парафина. Затем образцы лизируются в присутствии протеиназы К, и лизат наносится на спин-колонку. ДНК избирательно связывается с фильтром колонки в присутствии хаотропной соли. Связанная ДНК отмывается от примесей и элюируется в виде чистого препарата, пригодного для большинства молекулярно-биологических манипуляций, например, ПЦР.

Набор предназначен для выделения геномной ДНК из образцов животных тканей массой от 20 до 100 мкг. Очистка ДНК происходит за счёт её связывания с сорбентом колонок diaGene. Связанная ДНК отмывается от примесей и элюируется в виде чистого препарата. Выход ДНК зависит от типа ткани и может составлять до 10 мкг.