Наборы Holotype HLA — это современное решение для диагностики и определения человеческих лейкоцитарных антигенов (HLA). Они работают на основе метода секвенирования следующего поколения (NGS) на платформах Illumina и GeneMind. Эти наборы реагентов сочетают в себе высокую точность и удобство использования, позволяют получить информацию о гистосовместимости 5, 7, 11 локусов HLA в зависимости от типа набора. Материал для исследования — образцы геномной ДНК человека.
Подготовка образцов
- Анализ по 5 (А, В, С, DRB1, DQB1), 7 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1) или 11 (А, В, С, DRB1, DQB1, DPB1, DQA1, DRB3, DRB4, DRB5, DPA1) локусам HLA;
- для амплификации 11 локусов требуется менее 0,8 мкг ДНК;
- исходный материал — периферическая кровь, слюна, буккальный эпителий;
- одновременная загрузка до 288 образцов на стандартной проточной ячейке в 300 циклов с плотностью кластеров до 1000 K/mm².
Подготовка библиотеки
- Подготовка библиотеки для 24 образцов занимает 4 часа практического времени;
- получение результатов менее чем за 48 часов;
- библиотеки Holotype можно комбинировать с другими библиотеками, это позволит оптимизировать затраты на процесс секвенирования.
Секвенирование
- Секвенирование проводят на платформах Illumina: MiniSeq, MiSeq, iSeq и NextSeq, и на платформе GeneMind: FASTASeq 300;
- наборы совместимы с проточными ячейками любого размера в зависимости от необходимой пропускной способности;
- поддерживается химия на 300 и 500 циклов.
Анализ данных с помощью программного обеспечения HLA TWIN
- Полностью автоматизированный анализ после запуска секвенирования на платформе Illumina и GeneMind;
- время анализа образца из 11 локусов менее 5 минут с рекомендуемыми характеристиками;
- два независимых алгоритма генотипирования;
- 24 показателя контроля качества для получения достоверных результатов;
- сбалансированное покрытие между аллелями в локусе, между локусами в образце и среди образцов;
- глубокое и равномерное покрытие по всей длине целевого региона.
Технические характеристики Набора Holotype HLA 24/7
- Набор Holotype HLA 24/7 содержит все необходимые праймеры и реагенты, а также 24-луночный планшет для подготовки библиотеки;
- один набор рассчитан на анализ 24 образцов;
- типирование по 7 локусам HLA — I класса (A, B и C) и II класса (DPB1, DQA1, DQB1 и DRB1);
- набор Holotype HLA 24/7 может быть выполнен в одной из 4-х конфигураций, A1, A2, A3, A4, отличающихся идентификационными номерами лунок в планшете для подготовки библиотек. В конфигурации A1 стандартная идентификация от 1 до 24, в А2 – от 25 до 48, в А3 — от 49 до 72, в А4 — от 73 до 96. Совместное использование 4-х конфигураций набора позволяет одновременно проанализировать до 96 образцов;
- ПО в комплекте;
- наличие регистрационного удостоверения МИ (РЗН 2024/23361).