Видео. Обзор секвенатора MinION Mk1С, Oxford Nanopore Technologies, англ., 2020 г.

Секвенатор нанопоровый MinION

Это портативное устройство для прямого секвенирования ДНК и РНК в реальном времени.

В основе прибора ячейка с 512 нанопоровыми каналами (максимальная ёмкость), каждый из которых предназначен для анализа отдельной молекулы нуклеиновой кислоты. В сумме прибор позволяет получить до 30 Гб информации о последовательности ДНК. Длина прочтения, фактически, ограничена только длиной фрагмента нуклеиновой кислоты и составляет сотни тысяч нуклеотидов.

MinION подключается к USB-порту 3.0 ПК или ноутбука для вывода и анализа информации, полученной в процессе секвенирования. Никакое дополнительное компьютерное или лабораторное оборудование не требуется.

Комплект поставки:

• секвенатор MinION;
• набор реагентов для подготовки образцов;
• проточная ячейка для секвенирования SpotON Flow Cell (R9.4) Single;
• набор реагентов Flow Cell Priming Kit;
• набор реагентов для промывки проточной ячейки Flow Cell Wash Kit;
• контрольный набор, содержащий ДНК бактериофага Лямбда Control Expansion Pack.

Mk1C Capex – портативный высокопроизводительный нанопоровый секвенатор производства Oxford Nanopore Technologies, объединяющий в себе секвенирующий блок и управляющую станцию с дисплеем, предназначенный для запуска одной стандартной проточной ячейки R9 или R10. Этот прибор является обновленной версией секвенатора MinION.

В основе прибора ячейка с 512 нанопоровыми каналами (максимальная ёмкость), каждый из которых предназначен для анализа отдельной молекулы нуклеиновой кислоты. В сумме прибор позволяет получить до 45 Гб информации о последовательности ДНК за один запуск. Длина прочтения, фактически, ограничена только длиной фрагмента нуклеиновой кислоты и составляет сотни тысяч нуклеотидов.

Mk1C Capex включает управляющую станцию со следующими характеристиками:

• объем жесткого диска SSD, Тб – 1;
• объем оперативной памяти, Гб – 8;
• графические ускорители;
• операционная система – Linux;
• предустановленное ПО – MinKNOW, Guppy, EPI2ME;
• подключение – WiFi, Ethernet, USB 2.0, SIM.

Для работы прибора не требуется постоянное интернет-подключение, однако оно требуется для обновления программного обеспечения. Данные с прибора можно выгрузить на внешний носитель через порт USB (также есть порт для MicroSD карты памяти).

Комплект поставки: секвенатор Mk1C Capex со встроенным ПК.